مار تھوما چرچ، یا مالابار مار تھوما سیریاک چرچ، کیرالا میں سینٹ تھامس عیسائی برادری سے نکلا ہے۔ 19ویں صدی میں، برطانوی مشنریوں کے ساتھ رابطے اور بائبل کے مطالعہ نے مالانکارا چرچ کے اندر ایک اصلاحی تحریک کو جنم دیا۔ چرچ کی سرکاری تاریخ سال کی ہے۔ ۱۸۳۶ اسے اس اصلاحات کا نقطہ آغاز سمجھتا ہے۔

مار تھوما نے مشرقی چرچ کی بہت سی روایتی خصوصیات کو برقرار رکھا ہے، جبکہ بائبل کے مطالعہ اور انجیلی بشارت پر زور دیا ہے۔ ورلڈ کونسل آف چرچز اسے "تجدید مشرقی چرچ" کے طور پر بیان کرتی ہے۔ یہ ادارہ جاتی طور پر مالانکارا آرتھوڈوکس چرچ سے مماثل نہیں ہے، حالانکہ ان کی تاریخی جڑیں مشترک ہیں۔